神经所实验动物室成立于 1999 年，建筑面积为 600 m²，包括：动物饲养区 300 m²、动物实验区 180 m²和辅助区 120 m²。实验动物环境为大小鼠屏障系统（获SPF级动物实验室认证）；猫、兔、豚鼠、爪蟾、猴等开放系统。实验动物室有较完善的实验动物设施和严格的管理规章制度及操作规程，并取得了实验动物使用许可证。

2004 年神经所对原实验动物设施进行了改造。本着高标准、严要求的原则，设计征求了实验动物专家的意见，并经过多次论证，具有科学、先进、合理、管理方便、运行费低等特点，达到了国内实验动物设施的先进水平。改造后的实验动物室的净化区部分为恒温、恒定气压梯度控制，自动控制照明。工艺、布局先进，人流、物流、气流流向合理。还设有物品消毒传递系统，温度、风量、压力梯度控制系统，自动报警和电话通讯系统，以及备用电源系统。

实验动物室还配备了 3 间公用动物实验室，其设计新颖，配套齐全，管理规范，可供实验人员进行动物行为实验、动物手术、灌注取材等实验。

实验动物室将凭借先进的硬件条件，坚实的技术实力，一流的管理水平，为各课题组提供优质的实验动物和动物实验技术条件，全心全意为科研工作服务。